178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1548 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1548  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  100 
 
 		 274 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0178  protein of unknown function DUF980  47.64 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3371  protein of unknown function DUF980  46.12 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4583  protein of unknown function DUF980  40.64 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0532  hypothetical protein  41.59 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2231  protein of unknown function DUF980  36.1 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.335785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  31.33 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  29.64 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  31.82 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  29.25 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  29.25 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  29.96 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  32.49 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0602  hypothetical protein  33.19 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  28.35 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  28.35 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  28.35 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  28.35 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  0.00000000000208839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  29.79 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3868  protein of unknown function DUF980  29.06 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  28.99 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  27.56 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  30.57 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0677  hypothetical protein  28.33 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.358469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  25.88 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1293  hypothetical protein  29.24 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  29.13 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  30.21 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2196  protein of unknown function DUF980  29.6 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000615921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1531  hypothetical protein  28.33 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  29.96 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  28.63 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  28.69 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0929  hypothetical protein  27.73 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  32.45 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  27.39 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  30.71 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  27.3 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  26.95 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  28.31 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  27.98 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4995  hypothetical protein  27.46 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1075  hypothetical protein  28.14 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1447  protein of unknown function DUF980  37.84 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  27.8 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11700  hypothetical protein  27.71 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0422  hypothetical protein  28.84 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1820  hypothetical protein  26.27 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  26.64 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  27.72 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  26.14 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  25.43 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  24.58 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1184  hypothetical protein  31.53 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0742773  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2251  hypothetical protein  33.58 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2209  protein of unknown function DUF980  27.78 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.183224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3828  hypothetical protein  25.87 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0769  hypothetical protein  26.91 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107825  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12488  hypothetical protein  26.36 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2898  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636756  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3321  hypothetical protein  23.53 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2335  protein of unknown function DUF980  23.5 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  30.47 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1119  protein of unknown function DUF980  28.16 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1809  hypothetical protein  28.96 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00108479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1770  hypothetical protein  26.27 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.693928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1743  hypothetical protein  26.27 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1395  hypothetical protein  30.53 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2366  putative inner membrane protein  26.86 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00016651  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1821  protein of unknown function DUF980  26.75 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.571233  normal  0.0506575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2214  hypothetical protein  25.51 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.416427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1441  hypothetical protein  25.85 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.130559  hitchhiker  0.00999787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1027  protein of unknown function DUF980  28.71 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.196659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6247  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1832  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3110  hypothetical protein  29.38 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1856  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0231  protein of unknown function DUF980  30.23 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5133  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635971  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1368  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0948  hypothetical protein  24.7 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2136  hypothetical protein  26.12 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1858  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0039  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1129  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3127  hypothetical protein  27.47 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.363658  normal  0.161606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  28.12 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3095  protein of unknown function DUF980  26.67 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2458  protein of unknown function DUF980  33.64 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2557  protein of unknown function DUF980  30.2 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2711  hypothetical protein  25.31 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2502  hypothetical protein  29.72 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02840  hypothetical protein  26.52 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0013  hypothetical protein  23.81 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2119  hypothetical protein  24.89 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1479  hypothetical protein  26.71 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>