82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3321 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3321  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1439  hypothetical protein  55.7 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0827394  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12488  hypothetical protein  29.91 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1809  hypothetical protein  30.13 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00108479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3868  protein of unknown function DUF980  26.87 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  27.12 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  24.05 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  26.75 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  25.11 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  23.85 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  0.00000000000208839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  23.85 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  23.85 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  23.85 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0602  hypothetical protein  26.43 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1548  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  23.53 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  25.44 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  24.27 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  24.69 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  24.89 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  24.69 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  24.69 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  23.98 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  22.14 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2251  hypothetical protein  23.04 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1820  hypothetical protein  23.44 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144869  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0532  hypothetical protein  23.5 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  26.36 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3828  hypothetical protein  25.1 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1531  hypothetical protein  24.27 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  25.82 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0677  hypothetical protein  24.38 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.358469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  22.63 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  26.2 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  22.41 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1293  hypothetical protein  23.71 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1075  hypothetical protein  26.01 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11700  hypothetical protein  26.46 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  22.32 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  23.08 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  23.79 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  24.9 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  25.78 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3371  protein of unknown function DUF980  21.05 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  23.79 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0929  hypothetical protein  20.76 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  24.19 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4995  hypothetical protein  23.92 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2898  hypothetical protein  24 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636756  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  24.38 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2231  protein of unknown function DUF980  25 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.335785  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  24.6 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2119  hypothetical protein  19.92 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2136  hypothetical protein  24.43 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  25.34 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0769  hypothetical protein  21.88 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107825  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1441  hypothetical protein  22.69 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.130559  hitchhiker  0.00999787 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2196  protein of unknown function DUF980  24.21 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000615921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  24.37 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  22.5 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4583  protein of unknown function DUF980  34.48 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2214  hypothetical protein  22.27 
 
 		 281 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.416427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0178  protein of unknown function DUF980  37.74 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  21.43 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  21.43 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  21.43 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5133  hypothetical protein  22.87 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635971  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  23.01 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1743  hypothetical protein  22.35 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1858  hypothetical protein  21.85 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0039  hypothetical protein  21.85 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2209  protein of unknown function DUF980  24.1 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.183224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  23.81 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1856  hypothetical protein  22.48 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1368  hypothetical protein  21.85 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1129  hypothetical protein  21.85 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6247  hypothetical protein  22.48 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1832  hypothetical protein  22.48 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1770  hypothetical protein  22.35 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.693928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2366  putative inner membrane protein  23.48 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00016651  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0422  hypothetical protein  22.39 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>