120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2136 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2119  hypothetical protein  74.74 
 
 		 285 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1027  protein of unknown function DUF980  55.71 
 
 		 288 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.196659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1184  hypothetical protein  55.14 
 
 		 288 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0742773  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1119  protein of unknown function DUF980  55.25 
 
 		 288 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2366  putative inner membrane protein  52.25 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00016651  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0948  hypothetical protein  51.69 
 
 		 280 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1821  protein of unknown function DUF980  49.83 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.571233  normal  0.0506575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1770  hypothetical protein  52.72 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.693928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1743  hypothetical protein  52.72 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5133  hypothetical protein  51.85 
 
 		 277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635971  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6247  hypothetical protein  51.18 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1832  hypothetical protein  51.18 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1441  hypothetical protein  52.53 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.130559  hitchhiker  0.00999787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1856  hypothetical protein  51.52 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  51.38 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  51.38 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  51.38 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2214  hypothetical protein  51.38 
 
 		 281 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.416427  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1368  hypothetical protein  50.69 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1858  hypothetical protein  50.69 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0039  hypothetical protein  50.69 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1129  hypothetical protein  50.69 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  45.52 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  43.1 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  42.07 
 
 		 262 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  40.23 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  37.24 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2209  protein of unknown function DUF980  41.38 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.183224  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  39.85 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  36.27 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  39.07 
 
 		 271 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  41.91 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2898  hypothetical protein  40.45 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636756  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  39.64 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  39.64 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0422  hypothetical protein  37.46 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  38.71 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4995  hypothetical protein  39.15 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0769  hypothetical protein  38.49 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107825  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  38.71 
 
 		 271 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  37.63 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3828  hypothetical protein  39.5 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  37.32 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  39.1 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3127  hypothetical protein  36.96 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.363658  normal  0.161606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1075  hypothetical protein  40.52 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2502  hypothetical protein  36.49 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11700  hypothetical protein  38.29 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  38.08 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  35.66 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1618  hypothetical protein  37.63 
 
 		 285 aa  159  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2096  protein of unknown function DUF980  37.46 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1395  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3095  protein of unknown function DUF980  35.61 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2335  protein of unknown function DUF980  36.53 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2314  hypothetical protein  38.85 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.600189  hitchhiker  0.00085516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0013  hypothetical protein  34.63 
 
 		 250 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  35 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  35.12 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  35.69 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02840  hypothetical protein  34.6 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  29.82 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  29.82 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  29.82 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1587  protein of unknown function DUF980  31.54 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1293  hypothetical protein  33.46 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  30.82 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  29.93 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  0.00000000000208839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  30.82 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  30.63 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  34.94 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2162  hypothetical protein  33.07 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000383294  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2303  hypothetical protein  33.07 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000109705  hitchhiker  7.98783e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2166  hypothetical protein  33.07 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000309216  normal  0.207813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2219  hypothetical protein  33.07 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  0.573011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2066  hypothetical protein  33.85 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000683564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1479  hypothetical protein  30.83 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  30.39 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2392  hypothetical protein  30.59 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000626056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2490  hypothetical protein  30.59 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0602  hypothetical protein  34.22 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  29.8 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3110  hypothetical protein  33.46 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  29.93 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  31.71 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  28.83 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  32.08 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2561  hypothetical protein  31.64 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00550602  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1148  hypothetical protein  29.62 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113311  hitchhiker  0.0000000000000428732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01890  hypothetical protein  30.38 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000112317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1676  protein of unknown function DUF980  31.15 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0614873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01880  hypothetical protein  30.38 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000716342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2099  hypothetical protein  30.38 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.8651900000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1670  hypothetical protein  30.38 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  normal  0.343591 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0993  Mlc titration factor MtfA  31.15 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000614673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2819  Mlc titration factor MtfA  31.15 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000714473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2259  hypothetical protein  30.38 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000106573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>