More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1967 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1967  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1451  transcriptional regulator, LysR family  51.03 
 
 		 319 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2489  transcriptional regulator, LysR family  52.03 
 
 		 293 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161733  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1246  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4028  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3246  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769279  normal  0.647025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5707  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0403331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3770  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4598  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4486  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.978726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4049  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769313  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1370  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.260069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4969  transcriptional regulator, LysR family  42.51 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.82121  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1681  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492921  normal  0.530506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1449  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0254  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 330 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1281  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1384  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1043  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0525  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2555  LysR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1303  LysR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1034  LysR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6711  LysR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4331  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4472  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4419  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1393  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0256  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6066  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69880  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2390  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1996  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3305  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.655223  normal  0.0876929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1883  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1902  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5516  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0209  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0471708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.88 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1082  transcriptional regulator, LysR family  35.61 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.53 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.53 
 
 		 303 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5313  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.76 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0072  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.03 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.85 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0998  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0116  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5085  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5171  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.849729  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1364  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0933505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1350  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.960187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2996  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174451  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4571  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0360104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1282  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5194  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1389  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4560  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724855  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5665  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5261  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1533  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2694  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.484374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2795  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.85 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2724  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.85 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000916948  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2894  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.85 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00417784  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6807  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0691  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.16 
 
 		 302 aa  138  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2809  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2946  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4575  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0546566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6379  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7043  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1449  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6131  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.51 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4417  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.94 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4712  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01086  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6419  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 297 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2586  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4988  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 399 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4415  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3178  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.19 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.604913  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6921  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3254  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0927  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.62 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00141405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.45 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6448  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5754  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2151  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349903  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2291  LysR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83222 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10800  transcriptional regulator AmpR  35.49 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0253412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5947  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.287273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>