More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1392 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1392  ribosomal protein S11  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 131 aa  159  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  58.4 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 127 aa  157  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  58.54 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  58.4 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  156  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 183 aa  155  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  58.4 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  58.4 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 129 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  67.57 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  57.72 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  57.72 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  56 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  63.06 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  55.28 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  51.88 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  51.88 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  51.88 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  58.54 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  61.95 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0741  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  59.02 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  58.54 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0455  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.348659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0516  30S ribosomal protein S11  54.69 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.704694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  56.91 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  54.96 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  56 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>