256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0347 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0347  ribosomal protein L35  100 
 
 
67 aa  133  7.000000000000001e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040469  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  47.69 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  55 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  50.77 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  60 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  49.23 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  52.73 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  44.78 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  50.91 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  55.36 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  55.36 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
64 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  49.15 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  49.15 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
71 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  44.62 
 
 
65 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  46.43 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  43.28 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  46.43 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  49.09 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
67 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  52 
 
 
57 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  47.27 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  48 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  47.27 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  48.44 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  48 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  43.08 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  48 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  48 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  36.92 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  43.86 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  36.92 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0470  ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.835953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  47.27 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  41.54 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  46 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  52 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2502  ribosomal protein L35  46.43 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 
66 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  42.11 
 
 
65 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  48 
 
 
64 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  46 
 
 
65 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  48 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>