More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_B0005 on replicon NC_009789
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0047  dihydropteroate synthase 2  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0090  dihydropteroate synthase type-2  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0005  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0127  dihydropteroate synthase type-2  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2130  dihydropteroate synthase  66.15 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.202113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0060  dihydropteroate synthase  52.12 
 
 		 263 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5341  dihydropteroate synthase  52.69 
 
 		 283 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1582  dihydropteroate synthase  53.52 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0972411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0151  dihydropteroate synthase  53.52 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  45.2 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  44.8 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  44.35 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  39.54 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  34.1 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  39.46 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  39.46 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  39.25 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  38.29 
 
 		 316 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  35.98 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  36.29 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  39.33 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  39.84 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  36.09 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  37.12 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  37.45 
 
 		 394 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  34.63 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  38.29 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  38.29 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 		 281 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  37.89 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  39.59 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  40.82 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  35.21 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  36.6 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1175  dihydropteroate synthase  38.38 
 
 		 313 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  36.26 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  38.38 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  36.15 
 
 		 282 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  38.26 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  39.34 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  37.45 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1187  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  39.55 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  38 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  35.21 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 		 393 aa  148  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  34.1 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  35.21 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  39.46 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  36.9 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  34.5 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1974  dihydropteroate synthase  39.06 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  31.58 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  34.88 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  37.64 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 		 399 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0817  dihydropteroate synthase  36.53 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1298  dihydropteroate synthase  36.53 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  33.83 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  35.61 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  34.82 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  34.82 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  38.32 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  35.58 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  41.46 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  32.8 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  35.56 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  37.27 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  32.8 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>