More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1428 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1428  putative translaldolase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0364  putative translaldolase  72.81 
 
 
217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0154992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  58.69 
 
 
215 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  58.02 
 
 
214 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  59.43 
 
 
214 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  57.82 
 
 
214 aa  261  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  56.13 
 
 
216 aa  257  9e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  53.55 
 
 
216 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1454  transaldolase  62.09 
 
 
214 aa  254  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00117574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  56.62 
 
 
221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  55.66 
 
 
214 aa  252  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  55.66 
 
 
214 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  57.01 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  55.19 
 
 
214 aa  250  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  58.14 
 
 
217 aa  250  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  57.42 
 
 
215 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  56.46 
 
 
215 aa  248  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  55.66 
 
 
215 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  52.83 
 
 
214 aa  246  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  54.93 
 
 
216 aa  246  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  55.81 
 
 
217 aa  246  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  57.34 
 
 
222 aa  246  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  57.87 
 
 
223 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  55.02 
 
 
215 aa  246  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  57.8 
 
 
222 aa  246  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  55.98 
 
 
214 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  54.25 
 
 
217 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  54.25 
 
 
217 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  54.42 
 
 
216 aa  244  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  53.77 
 
 
217 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  55.5 
 
 
214 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  54.72 
 
 
214 aa  241  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  53.55 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  50.71 
 
 
215 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  53.77 
 
 
221 aa  241  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  53.49 
 
 
215 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  53.95 
 
 
215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  55.5 
 
 
223 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  53.49 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  54.55 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  54.17 
 
 
226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  52.58 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  56.74 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  52.13 
 
 
218 aa  237  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  50.24 
 
 
215 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  54.71 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  50.23 
 
 
217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  55.96 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  51.61 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  52.31 
 
 
218 aa  232  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  51.83 
 
 
218 aa  232  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  54.5 
 
 
217 aa  231  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  51.18 
 
 
213 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  49.77 
 
 
215 aa  228  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  50.46 
 
 
222 aa  228  5e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  52.13 
 
 
213 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  48.83 
 
 
221 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  56.67 
 
 
215 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  51.14 
 
 
219 aa  226  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  51.61 
 
 
221 aa  225  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  52.31 
 
 
217 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  54.42 
 
 
215 aa  225  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  46.98 
 
 
215 aa  224  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  51.63 
 
 
217 aa  223  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  51.15 
 
 
218 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1846  putative translaldolase  51.38 
 
 
222 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  53.49 
 
 
219 aa  221  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  48.36 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  54.76 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  52.09 
 
 
216 aa  221  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  50.7 
 
 
215 aa  221  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  54.76 
 
 
217 aa  221  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3399  putative translaldolase  50.45 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3409  putative translaldolase  50.45 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3179  putative translaldolase  50.45 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.319562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3080  putative translaldolase  50.45 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3430  putative translaldolase  50.45 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3411  putative translaldolase  50.45 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  50.23 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3386  putative translaldolase  50.45 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.433866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3103  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2088  putative translaldolase  57.34 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3163  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  53.74 
 
 
218 aa  218  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  50.93 
 
 
218 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  47.87 
 
 
213 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  52.61 
 
 
217 aa  217  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  49.07 
 
 
219 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2174  putative transaldolase  59.53 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  49.77 
 
 
217 aa  215  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23680  transaldolase  50.22 
 
 
226 aa  215  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00402875  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  50 
 
 
213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>