More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1015 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1015  ribosomal protein S9  100 
 
 
138 aa  278  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.230141  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  56.06 
 
 
131 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  51.85 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  130  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  52.42 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  53.23 
 
 
132 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  54.84 
 
 
131 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  54.84 
 
 
131 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  52.42 
 
 
132 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  52.42 
 
 
132 aa  120  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  49.61 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  47.58 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  47.66 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  47.66 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  47.62 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  46.88 
 
 
129 aa  115  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  45.65 
 
 
137 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  45.24 
 
 
161 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  45.24 
 
 
161 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  46.27 
 
 
135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  50.81 
 
 
264 aa  113  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  48.39 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  45.24 
 
 
162 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  46.46 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  49.19 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  45.52 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  47.29 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  45.24 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  45.24 
 
 
130 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  47.58 
 
 
133 aa  110  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 
130 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  47.62 
 
 
130 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
154 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
161 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  43.48 
 
 
137 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  46.77 
 
 
138 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  47.24 
 
 
129 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  48.39 
 
 
130 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  45.74 
 
 
130 aa  110  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  47.29 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  44.03 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  45.24 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  47.24 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19771  30S ribosomal protein S9  44.12 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1102  30S ribosomal protein S9  44.12 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  44.44 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  49.61 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  45.24 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  47.62 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>