61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0011 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.785527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0097  tRNA-Ser  88.04 
 
 		 92 bp  95.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0005  tRNA-Ser  87.37 
 
 		 95 bp  69.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000565734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  83.7 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0006  tRNA-Ser  82.61 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000844947  hitchhiker  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  83.7 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0055  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.265922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0056  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0054  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0056  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0176  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000019033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0010  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.812149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0004  tRNA-Ser  82.11 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366814 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0009  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_626  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  82.02 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.3235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0014  tRNA-Ser  85.29 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0004  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0041  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.368592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t07  tRNA-Ser  83.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0002  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000899468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  83.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0043  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0053  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00121332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0007  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0773482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  83.78 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0006  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000515355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0042  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>