40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0024 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  89.71 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  87.34 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0030  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 92 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.305018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0027  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0010  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.785527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0026  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.580647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.3235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_626  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0010  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.812149  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0176  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0004  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0773482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0059  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  88 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  88 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3054  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4306  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1581  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  88 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1969  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3020  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.419002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2954  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0070  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2643  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0810  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0309716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>