14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0010 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239183  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0005  tRNA-Ser  91.67 
 
 
96 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0006  tRNA-Ser  93.62 
 
 
92 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000844947  hitchhiker  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0097  tRNA-Ser  93.62 
 
 
92 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107664  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0005  tRNA-Ser  83.16 
 
 
95 bp  58  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000565734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  91.67 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  89.58 
 
 
96 bp  56  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.785527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  93.94 
 
 
96 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  87.5 
 
 
96 bp  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  91.67 
 
 
93 bp  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  96.3 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0017  tRNA-Ser  93.33 
 
 
92 bp  44.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000565076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>