69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1714 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1714  putative esterase  100 
 
 
675 aa  1411    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  24.53 
 
 
369 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  27.44 
 
 
315 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  22.22 
 
 
295 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  23.64 
 
 
273 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  29.61 
 
 
295 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  29.61 
 
 
295 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  26.95 
 
 
270 aa  59.7  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  30.98 
 
 
295 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2329  putative esterase  27.32 
 
 
268 aa  58.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  28.88 
 
 
286 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  25.91 
 
 
328 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  23.63 
 
 
296 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  30.22 
 
 
302 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  22.92 
 
 
274 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  28.65 
 
 
282 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  28.65 
 
 
286 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  29.08 
 
 
296 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  25 
 
 
363 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  25.64 
 
 
301 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  25.9 
 
 
368 aa  55.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  22.99 
 
 
381 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06770  predicted esterase  28.12 
 
 
312 aa  54.3  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  26.11 
 
 
299 aa  54.3  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  23 
 
 
289 aa  54.3  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  25.89 
 
 
283 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  26.45 
 
 
327 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  22.92 
 
 
269 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  26.45 
 
 
327 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  24.86 
 
 
276 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  29.24 
 
 
392 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0954  putative esterase  27.6 
 
 
346 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  23.67 
 
 
295 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  25.27 
 
 
401 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  27.85 
 
 
456 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  28.05 
 
 
434 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2339  putative esterase  26.19 
 
 
288 aa  51.2  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  26.54 
 
 
388 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.56 
 
 
640 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  27.98 
 
 
332 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  23.91 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0297  hydrolase  22.99 
 
 
272 aa  50.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00178815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  23.5 
 
 
385 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  25.52 
 
 
272 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3861  enterochelin esterase and related enzymes-like  26.34 
 
 
352 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  22.71 
 
 
291 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2502  putative esterase  28 
 
 
360 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519739  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3478  putative esterase  26.42 
 
 
356 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429701  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  27.37 
 
 
317 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  25 
 
 
256 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  27.37 
 
 
317 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  23.17 
 
 
640 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  24.51 
 
 
314 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  27.37 
 
 
317 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  24.86 
 
 
395 aa  45.8  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  23.16 
 
 
341 aa  45.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  24.27 
 
 
708 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 
837 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4543  hypothetical protein  24.64 
 
 
308 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  26.88 
 
 
383 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  27.53 
 
 
311 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  23.48 
 
 
388 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0269  S-formylglutathione hydrolase  26.15 
 
 
251 aa  44.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  23.91 
 
 
379 aa  44.3  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  24 
 
 
375 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  24.29 
 
 
319 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  27.12 
 
 
307 aa  43.9  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  26.04 
 
 
277 aa  43.9  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4525  putative esterase  23.92 
 
 
277 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0383068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>