172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2339 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2339  putative esterase  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  38.06 
 
 
295 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  39.51 
 
 
379 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  38.75 
 
 
363 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  37.19 
 
 
285 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  33.11 
 
 
434 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4527  putative esterase  34.01 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.859606 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0297  hydrolase  32.42 
 
 
272 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00178815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  37.22 
 
 
370 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4543  hypothetical protein  29.84 
 
 
308 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0723  putative esterase  44.94 
 
 
200 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.173587  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2741  putative esterase  32.59 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2329  putative esterase  29.89 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4525  putative esterase  35.27 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0383068  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05095  hypothetical protein  27.41 
 
 
329 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0939  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  29.46 
 
 
478 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0402  putative esterase  33.19 
 
 
264 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  26.74 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48328  predicted protein  29.95 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1038  putative esterase  29.46 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1067  putative esterase  29.46 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.256453 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  25.88 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  25.17 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  27.05 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  28.31 
 
 
640 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  28.88 
 
 
430 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0439  putative esterase  23.62 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  26.62 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  24.2 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  29.68 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  29.5 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  25.47 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  30.15 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  27.2 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  23.67 
 
 
526 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  23.67 
 
 
526 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  28.21 
 
 
401 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  30.63 
 
 
423 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  24.79 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  29.81 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  24.52 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  28.48 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  25.69 
 
 
329 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  27.46 
 
 
422 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  26.29 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1124  acetyl esterase  25.38 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  26.21 
 
 
392 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  28.42 
 
 
445 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1150  hypothetical protein  25.38 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1131  acetyl esterase  25.38 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1242  hypothetical protein  25.38 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.211927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1310  hypothetical protein  25.38 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000227034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1387  hypothetical protein  25.38 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00153591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1349  hypothetical protein  25.38 
 
 
243 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1284  hypothetical protein  25.38 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  25.32 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  25.57 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  24.69 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2744  putative esterase  25.19 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4060  hypothetical protein  25.38 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770329  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  22.44 
 
 
638 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  23.1 
 
 
304 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  26 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1478  putative esterase  25.53 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  26.12 
 
 
437 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0946  putative esterase  25.12 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1136  putative esterase  23.48 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.67 
 
 
640 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  26.95 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0458  putative esterase  23.7 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  29.19 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5724  putative esterase  26.49 
 
 
342 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818383  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2405  putative esterase  22.87 
 
 
273 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000464858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  22.5 
 
 
412 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  26.03 
 
 
305 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1939  putative esterase  26.97 
 
 
342 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.240589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.46 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1714  putative esterase  26.19 
 
 
675 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1112  putative esterase  24.23 
 
 
409 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291043  normal  0.610364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3073  enterochelin esterase  24.6 
 
 
414 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2509  esterase  20 
 
 
405 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  25.71 
 
 
383 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3478  putative esterase  29.48 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  26.32 
 
 
392 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  20.38 
 
 
541 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2694  esterase  20 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.360793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2970  enterochelin esterase  24 
 
 
414 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  28.21 
 
 
385 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2917  enterochelin esterase  24.4 
 
 
414 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.112006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  25.81 
 
 
319 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  25 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  28.48 
 
 
369 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1666  putative esterase  26.34 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  27.67 
 
 
369 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  24.58 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2449  putative esterase  20.38 
 
 
398 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.922476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  24.88 
 
 
448 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  30 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>