152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2988 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 
374 aa  770    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  33.6 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  31.15 
 
 
291 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  33.02 
 
 
339 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  29.81 
 
 
287 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  31.37 
 
 
330 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  35.39 
 
 
422 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  33.33 
 
 
294 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  30.22 
 
 
310 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  29.81 
 
 
287 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  28.47 
 
 
420 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  29 
 
 
400 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  31.33 
 
 
285 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  30.47 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  27.09 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  31.23 
 
 
273 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  28.17 
 
 
304 aa  93.2  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  31.47 
 
 
298 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  28.39 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  30.63 
 
 
288 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  30.22 
 
 
477 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  35.29 
 
 
404 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  31.47 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  27.67 
 
 
305 aa  86.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0973  putative esterase  30.43 
 
 
296 aa  86.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  27.17 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  27.17 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  28 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  25.76 
 
 
312 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3791  putative esterase  30.04 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  29.57 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  29.57 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  32.43 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2744  putative esterase  30.77 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  28.86 
 
 
462 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  33.12 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2405  putative esterase  30.83 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000464858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  29.5 
 
 
384 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  31.93 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  25 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  27.89 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  28.46 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  29 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  29 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  27.04 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  27.67 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  33.74 
 
 
439 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  32.91 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  32.2 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  25.44 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3833  IroE protein  28.15 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  30.82 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3491  esterase  31.71 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1466  IroE protein  27.41 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  31.22 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  31.88 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0676  putative esterase  58.06 
 
 
79 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3479  esterase  30.73 
 
 
275 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  27.74 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3783  hypothetical protein  30.73 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3579  hypothetical protein  30.73 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3863  hypothetical protein  30.73 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1939  putative esterase  27.14 
 
 
342 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.240589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  29.86 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  31.52 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  28.57 
 
 
434 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  27.17 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  28.92 
 
 
329 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4185  hypothetical protein  31.41 
 
 
183 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2470  esterase  28.38 
 
 
307 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000007439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1979  IroE protein  27.61 
 
 
273 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2329  putative esterase  24.02 
 
 
268 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  26.49 
 
 
307 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0681  putative esterase  30.54 
 
 
284 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  26.63 
 
 
448 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  29.21 
 
 
294 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2370  putative esterase  25.61 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2449  putative esterase  24.54 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.922476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  27.93 
 
 
541 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  31.25 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  24.69 
 
 
280 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  29.39 
 
 
306 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.64 
 
 
640 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  26.12 
 
 
640 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2760  putative esterase  27.7 
 
 
368 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00548916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  29.09 
 
 
541 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3796  putative esterase  25.91 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6228  putative esterase  26.78 
 
 
273 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.226912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4525  putative esterase  30.92 
 
 
277 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0383068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21170  esterase  25.2 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  29.37 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36990  esterase  27.51 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0582234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1694  putative esterase  28.85 
 
 
313 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2509  esterase  29.09 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2694  esterase  29.09 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.360793  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07801  putative siderophore-degrading esterase (Eurofung)  30 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  25.61 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>