180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1658 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  100 
 
 
430 aa  880    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  74.69 
 
 
423 aa  634  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  51.31 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  28.73 
 
 
448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  26.63 
 
 
412 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  26.62 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  32.32 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  26.56 
 
 
445 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  29.19 
 
 
351 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  30.66 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  26.91 
 
 
307 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  25.81 
 
 
384 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  28.94 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  30.36 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  28.94 
 
 
399 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  25.35 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  25.29 
 
 
421 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  26.08 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  27.37 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  30.64 
 
 
273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  26.56 
 
 
386 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  26.65 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  28.63 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  26.71 
 
 
462 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  30.33 
 
 
298 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  31.79 
 
 
288 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  25.77 
 
 
460 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  36.13 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  26.17 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  22.76 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  25.93 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 
283 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  31.32 
 
 
310 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  28.52 
 
 
287 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  31.52 
 
 
272 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1466  IroE protein  30.47 
 
 
272 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  30.89 
 
 
272 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.39 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3833  IroE protein  30.08 
 
 
272 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3491  esterase  31.02 
 
 
275 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  28.91 
 
 
287 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  32.2 
 
 
276 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  30.97 
 
 
309 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  30.2 
 
 
275 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2405  putative esterase  28.46 
 
 
273 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000464858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0681  putative esterase  32.49 
 
 
284 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3579  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3479  esterase  29.8 
 
 
275 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3863  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3783  hypothetical protein  29.39 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  26.1 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  24.57 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  26.74 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  25.91 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2744  putative esterase  34.09 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  26.42 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4575  putative esterase  31.19 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.971846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  31.63 
 
 
285 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  28.37 
 
 
422 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  27.78 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  29.59 
 
 
295 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0973  putative esterase  31.43 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  28.34 
 
 
305 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0583  putative esterase  31.46 
 
 
296 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  30.3 
 
 
339 aa  77  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  26.7 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1939  putative esterase  32.22 
 
 
342 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.240589 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07801  putative siderophore-degrading esterase (Eurofung)  39.36 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332933 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  30.3 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  32.93 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2370  putative esterase  34.5 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  25.1 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  33.12 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  34.29 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2339  putative esterase  27.56 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0939  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  27.18 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3796  putative esterase  28.49 
 
 
298 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0577  putative esterase  27.78 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  32.73 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  28.27 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3965  hypothetical protein  29.34 
 
 
304 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.956387  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2741  putative esterase  30 
 
 
318 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29340  hypothetical protein  28.04 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3791  putative esterase  26.53 
 
 
262 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  28.39 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1979  IroE protein  31.14 
 
 
273 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  28.9 
 
 
306 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  24.87 
 
 
312 aa  63.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2565  putative esterase  31.32 
 
 
277 aa  63.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361057  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21170  esterase  26.24 
 
 
365 aa  63.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0297  hydrolase  26.67 
 
 
272 aa  62.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00178815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0566  putative esterase  28.07 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.798413  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4185  hypothetical protein  33.7 
 
 
183 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  22.56 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0532  putative esterase  28.4 
 
 
297 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6228  putative esterase  28.79 
 
 
273 aa  60.1  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.226912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0975  putative esterase  33.33 
 
 
321 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  26.98 
 
 
312 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  28 
 
 
279 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>