57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0981 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0981  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  568  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1177  hypothetical protein  67.43 
 
 
268 aa  368  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2582  hypothetical protein  39.31 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.148491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3416  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 
268 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0827  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0238202  normal  0.253698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2007  hypothetical protein  33.84 
 
 
280 aa  175  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.513637  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3735  hypothetical protein  35.91 
 
 
279 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0775  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
247 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.841147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  21.89 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  25.13 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.39 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  23.92 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  22.56 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  19.35 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  24.12 
 
 
255 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 
284 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  22.9 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  24.08 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4419  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
399 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582229  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  21.32 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  22.55 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  31.73 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  21.89 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  21.89 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  21.89 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  29.81 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  29.81 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
376 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  21.76 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 
288 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  20.39 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  20.66 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
277 aa  42  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  27.88 
 
 
323 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
281 aa  42  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>