26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0746 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  51.81 
 
 
758 aa  743    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  100 
 
 
816 aa  1646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  47.85 
 
 
782 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  34.74 
 
 
722 aa  325  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  29.11 
 
 
736 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  29.9 
 
 
704 aa  225  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  19.97 
 
 
712 aa  107  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  20.35 
 
 
713 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  19.93 
 
 
713 aa  94.4  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  19.66 
 
 
758 aa  90.9  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  19.71 
 
 
713 aa  89  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  21.57 
 
 
699 aa  88.6  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  19.63 
 
 
713 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  19.75 
 
 
708 aa  81.6  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.37 
 
 
715 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  21.31 
 
 
699 aa  77  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  30.56 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  21.01 
 
 
729 aa  55.1  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55197  oligosaccharyl transferase  24.75 
 
 
911 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.75 
 
 
851 aa  47.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0438  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  28.38 
 
 
826 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  33.78 
 
 
743 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.56 
 
 
851 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  34.62 
 
 
840 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  25.49 
 
 
853 aa  44.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  34.62 
 
 
837 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>