27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3699 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  100 
 
 
722 aa  1462    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  36.97 
 
 
782 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  34.91 
 
 
758 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  34.92 
 
 
816 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  27.69 
 
 
704 aa  216  9e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.65 
 
 
736 aa  204  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.43 
 
 
715 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  19.89 
 
 
699 aa  100  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  21.07 
 
 
709 aa  99  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  19.96 
 
 
713 aa  90.9  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  20.69 
 
 
713 aa  87.4  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  19.74 
 
 
713 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  20.72 
 
 
713 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  17.89 
 
 
712 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  23.34 
 
 
708 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  20.63 
 
 
758 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  20 
 
 
699 aa  64.7  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55197  oligosaccharyl transferase  24.29 
 
 
911 aa  64.7  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  23.58 
 
 
743 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.33 
 
 
851 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55198  STT3 subunit-like protein  24.44 
 
 
894 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  19.75 
 
 
729 aa  52.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.2 
 
 
853 aa  52  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1409  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.14 
 
 
871 aa  50.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  41.51 
 
 
712 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.1 
 
 
851 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.4 
 
 
853 aa  44.3  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>