20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1143 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  98.74 
 
 
713 aa  1424    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  57.26 
 
 
712 aa  804    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
713 aa  1436    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  97.34 
 
 
713 aa  1406    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  48.06 
 
 
708 aa  647    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  47.29 
 
 
699 aa  617  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  45.76 
 
 
758 aa  610  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  46.19 
 
 
729 aa  570  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  40.28 
 
 
713 aa  499  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  41.8 
 
 
699 aa  496  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  39.92 
 
 
715 aa  484  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  33.99 
 
 
709 aa  365  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.72 
 
 
704 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.28 
 
 
736 aa  107  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  20.95 
 
 
758 aa  104  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  24.27 
 
 
782 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.35 
 
 
816 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  19.19 
 
 
722 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.39 
 
 
853 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  22.74 
 
 
853 aa  43.9  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>