22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1474 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  54.48 
 
 
715 aa  783    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 
699 aa  1419    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  42.91 
 
 
758 aa  580  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  42.86 
 
 
708 aa  530  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  42.03 
 
 
699 aa  530  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  40.86 
 
 
729 aa  514  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  43.32 
 
 
712 aa  510  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  41.8 
 
 
713 aa  498  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  41.8 
 
 
713 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  41.14 
 
 
713 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  38.36 
 
 
713 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  32.91 
 
 
709 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.65 
 
 
704 aa  124  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.31 
 
 
736 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  20.73 
 
 
782 aa  94.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.54 
 
 
853 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  23.89 
 
 
722 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  20.76 
 
 
758 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.1 
 
 
816 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  19.86 
 
 
851 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.87 
 
 
851 aa  57.4  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  22.06 
 
 
853 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>