22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0452 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  48.47 
 
 
758 aa  718    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  46.92 
 
 
712 aa  646    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  100 
 
 
699 aa  1405    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  68.67 
 
 
708 aa  976    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  49.29 
 
 
729 aa  661    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  47.29 
 
 
713 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  47.29 
 
 
713 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  47.37 
 
 
713 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  43.04 
 
 
713 aa  571  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  41.99 
 
 
699 aa  531  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  41.85 
 
 
715 aa  524  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  37.87 
 
 
709 aa  464  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.63 
 
 
704 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.28 
 
 
736 aa  104  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  23.34 
 
 
758 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.55 
 
 
816 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  21.01 
 
 
782 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  20 
 
 
722 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.28 
 
 
853 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.96 
 
 
851 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.51 
 
 
853 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.64 
 
 
851 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>