21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1249 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  77.49 
 
 
853 aa  1342    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  70.34 
 
 
853 aa  1259    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1409  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  56.37 
 
 
871 aa  957    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  90.72 
 
 
851 aa  1572    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  100 
 
 
851 aa  1717    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  20.87 
 
 
699 aa  57.4  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.05 
 
 
736 aa  56.6  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  25.38 
 
 
758 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  22.36 
 
 
758 aa  53.5  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  21.99 
 
 
713 aa  52.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  19.89 
 
 
1030 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  62.16 
 
 
712 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  23.64 
 
 
699 aa  49.7  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.75 
 
 
816 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.04 
 
 
2073 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  21.58 
 
 
708 aa  47  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  23.45 
 
 
713 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0640  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  30.14 
 
 
731 aa  45.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.7 
 
 
736 aa  45.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  21.1 
 
 
722 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0438  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  30.88 
 
 
826 aa  44.3  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>