23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1383 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  100 
 
 		 758 aa  1528    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 		 699 aa  715    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  49.26 
 
 		 708 aa  727    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  45.77 
 
 		 729 aa  642    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  45.89 
 
 		 713 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  45.76 
 
 		 713 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  45.62 
 
 		 713 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  43.37 
 
 		 712 aa  587  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  40.29 
 
 		 713 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  42.25 
 
 		 699 aa  562  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  40.13 
 
 		 715 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  34.04 
 
 		 709 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  19.42 
 
 		 704 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  19.66 
 
 		 816 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.52 
 
 		 736 aa  70.5  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  25.49 
 
 		 758 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.36 
 
 		 851 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  21 
 
 		 853 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.83 
 
 		 853 aa  52  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.47 
 
 		 851 aa  51.2  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  24.32 
 
 		 782 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  19.21 
 
 		 722 aa  47.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82607  oligosaccharyl transferase subunit  30.56 
 
 		 745 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.214118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>