19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1253 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  57.26 
 
 		 713 aa  817    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  100 
 
 		 712 aa  1442    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  57.26 
 
 		 713 aa  820    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 699 aa  649    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  57.26 
 
 		 713 aa  816    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  49.36 
 
 		 708 aa  679    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  44.33 
 
 		 758 aa  624  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  48.24 
 
 		 729 aa  601  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  43.32 
 
 		 699 aa  526  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  41.44 
 
 		 713 aa  523  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  41.89 
 
 		 715 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  35.21 
 
 		 709 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.4 
 
 		 704 aa  124  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  19.92 
 
 		 758 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  19.35 
 
 		 782 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.82 
 
 		 736 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.1 
 
 		 816 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  18.08 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.77 
 
 		 853 aa  48.5  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>