144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0619 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0619  quinol dehydrogenase membrane component  100 
 
 
299 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  29.93 
 
 
298 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  31.67 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  27.27 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.31 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.33 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  28.93 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.75 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  27.4 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  29.93 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  27.4 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  32.04 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  27.4 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.05 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  31.91 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  31.21 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.21 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  23.57 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  28.42 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  29.29 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  27.85 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  29.58 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  27.87 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  30.85 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.24 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  31.54 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  27.46 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  29.12 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  28.83 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  28.11 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  28.32 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  29.12 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  26.41 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  28.77 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  28.77 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  28.77 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  28.77 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  28.77 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.17 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  26.03 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  28.16 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  28.27 
 
 
316 aa  62.8  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.81 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  28.72 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  28.67 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  25.89 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.69 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  27.63 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.76 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.09 
 
 
588 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  23.35 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  23.05 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  22.92 
 
 
357 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0118  iron-sulfur cluster-binding protein  27.97 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  27.27 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.57 
 
 
507 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.53 
 
 
238 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22780  polyferredoxin  29.58 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.49 
 
 
470 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.58 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  22.97 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  24.92 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  22.97 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  24.58 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.97 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.97 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.98 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.28 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.38 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.97 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  22.97 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.51 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  24.58 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.35 
 
 
334 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0642  Polyferredoxin-like protein  25.31 
 
 
290 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000712923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  22.62 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.74 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.59 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.34 
 
 
368 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.16 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3116  iron-sulfur cluster-binding protein  27.17 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.39 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
510 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.12 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.06 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
841 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  22.93 
 
 
233 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.12 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.45 
 
 
504 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.55 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.27 
 
 
368 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.11 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27420  4Fe-4S protein  25.46 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  25.67 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.34 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.19 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  23.08 
 
 
918 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.43 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.64 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  26.62 
 
 
302 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>