More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0346 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0346  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.564303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  81.71 
 
 		 254 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  83.68 
 
 		 271 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  80.43 
 
 		 260 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  67.72 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  73.91 
 
 		 261 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  66.52 
 
 		 267 aa  325  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  56.47 
 
 		 257 aa  318  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  60.08 
 
 		 343 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  60.08 
 
 		 314 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  64.57 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  60.57 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  62.05 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  58.72 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  55.69 
 
 		 257 aa  308  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 304 aa  305  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  59.18 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  55.08 
 
 		 301 aa  304  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  61.3 
 
 		 233 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  59.38 
 
 		 291 aa  299  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  57.72 
 
 		 281 aa  296  3e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  56.96 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  59.41 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 289 aa  293  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  61.78 
 
 		 232 aa  291  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  56.15 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  60.54 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  59.73 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  58.67 
 
 		 235 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  56.9 
 
 		 259 aa  288  7e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  60.71 
 
 		 244 aa  288  9e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  54.58 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  52.94 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  57.74 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  59.91 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  54.15 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  60.63 
 
 		 263 aa  281  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  55.34 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  54.94 
 
 		 300 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 236 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  51.47 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  51.37 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  55.11 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  55.11 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  56.7 
 
 		 255 aa  278  9e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  56.44 
 
 		 232 aa  277  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  55.12 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  52.23 
 
 		 246 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  54.46 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  52.96 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  53.23 
 
 		 330 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  52.17 
 
 		 332 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 304 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  52.94 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  52 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  52.17 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  56.44 
 
 		 263 aa  275  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  51.65 
 
 		 282 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 241 aa  274  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 241 aa  274  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 257 aa  274  9e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  53.14 
 
 		 258 aa  274  9e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  53.91 
 
 		 310 aa  273  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  52.76 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  52 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  53.36 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  51.78 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  57.73 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  52.99 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  53.09 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  52.16 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  56.3 
 
 		 334 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  53.88 
 
 		 353 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  55.75 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>