More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3418 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  70.31 
 
 		 266 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  60.94 
 
 		 492 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  63.08 
 
 		 275 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  63.08 
 
 		 275 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  60.94 
 
 		 399 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  60.94 
 
 		 338 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  63.08 
 
 		 248 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  61.54 
 
 		 209 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  60.94 
 
 		 266 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  60.94 
 
 		 266 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2130  integrase catalytic subunit  59.38 
 
 		 134 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  60.94 
 
 		 362 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  60.94 
 
 		 362 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  60.94 
 
 		 362 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1799  hypothetical protein  63.16 
 
 		 81 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  50.77 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  50.77 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  50.77 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  53.12 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  52.78 
 
 		 249 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  52.78 
 
 		 249 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  52.78 
 
 		 249 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  53.97 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  57.41 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  57.41 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  57.41 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  45.33 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  45.24 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  46.05 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  46.05 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  46.05 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  38.1 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  42.67 
 
 		 281 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  47.22 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4044  IS3 family transposase orfB  56.36 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  54.72 
 
 		 262 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  54.72 
 
 		 262 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  54.72 
 
 		 262 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  42.67 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  54.72 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3762  ISxcd1 transposase  50.91 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  52.83 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  52.83 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0357  putative transposase  54.55 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  44 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  43.28 
 
 		 270 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2898  ISxac2 transposase  52.83 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  43.55 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  39.51 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  26.4 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 375 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  25.6 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  25.6 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  25.6 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  27.2 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  33.75 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1352  hypothetical protein  43.1 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158984  hitchhiker  0.000169099 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  25.4 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  36.25 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  33.75 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  34.21 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  33.75 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  33.75 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  41.27 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  33.75 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  33.75 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  33.75 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  33.75 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04488  transposase  33.75 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  33.75 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  25.6 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  33.75 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  33.75 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  32.26 
 
 		 290 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  32.26 
 
 		 290 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>