More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4044 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4044  IS3 family transposase orfB  100 
 
 		 111 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  65.48 
 
 		 266 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  56.98 
 
 		 266 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 		 362 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 		 362 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 		 362 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  56.98 
 
 		 266 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  56.98 
 
 		 266 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  54.12 
 
 		 399 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  55.81 
 
 		 209 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  54.12 
 
 		 492 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  54.12 
 
 		 338 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  57.32 
 
 		 249 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  57.32 
 
 		 249 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  57.32 
 
 		 249 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  55.95 
 
 		 362 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  55.95 
 
 		 362 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  55.95 
 
 		 362 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2130  integrase catalytic subunit  52.33 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1799  hypothetical protein  57.69 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  56.1 
 
 		 288 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  55.7 
 
 		 271 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  55.7 
 
 		 271 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  55.7 
 
 		 271 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 275 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 275 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 248 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 		 265 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 		 265 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 		 265 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 272 aa  87.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  46.51 
 
 		 262 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  46.51 
 
 		 262 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  46.51 
 
 		 262 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  46.51 
 
 		 262 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  46.51 
 
 		 262 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  46.51 
 
 		 262 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  46.99 
 
 		 281 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  50 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  48.75 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  44.58 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  46.25 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  45.12 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  46.75 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  43.9 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  43.9 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  43.9 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  43.37 
 
 		 254 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  44.87 
 
 		 267 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0728  hypothetical protein  46.27 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  43.04 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  43.04 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  43.04 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  43.04 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  43.04 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  43.04 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  43.04 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  44.74 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  44.74 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  44.74 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  44.74 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3763  ISxcd1 transposase  55.36 
 
 		 52 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  39.53 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3418  hypothetical protein  56.36 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  35.56 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  37.63 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  37.63 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  37.63 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  37.63 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  41.1 
 
 		 375 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2777  transposase  43.24 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  41.1 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2874  hypothetical protein  60.47 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  39.47 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  41.1 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  37.97 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>