More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3762 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3762  ISxcd1 transposase  100 
 
 
192 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  82.97 
 
 
266 aa  322  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  82.97 
 
 
266 aa  322  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  75.82 
 
 
266 aa  299  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  68.68 
 
 
266 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  61.46 
 
 
275 aa  261  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  61.46 
 
 
275 aa  261  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  65.38 
 
 
265 aa  260  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  64.84 
 
 
265 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  64.84 
 
 
265 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  65.19 
 
 
362 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  65.19 
 
 
362 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  92.86 
 
 
209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  65.19 
 
 
362 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
362 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
362 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
362 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  63.58 
 
 
248 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  63.13 
 
 
288 aa  244  8e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  57.29 
 
 
271 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  57.29 
 
 
271 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  57.29 
 
 
271 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  66.67 
 
 
249 aa  234  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  66.67 
 
 
249 aa  234  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  66.67 
 
 
249 aa  234  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1801  hypothetical protein  66.45 
 
 
282 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  49.45 
 
 
281 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  47.87 
 
 
281 aa  175  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  47.73 
 
 
270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  47.73 
 
 
270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  47.73 
 
 
270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  50.29 
 
 
270 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  47.73 
 
 
282 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
262 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
262 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
262 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
262 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
262 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
262 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
242 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
242 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
242 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
242 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  45.05 
 
 
264 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  42.31 
 
 
273 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  38.54 
 
 
272 aa  143  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  44 
 
 
270 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4215  ISxcd1 transposase  57.89 
 
 
123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  52.46 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  52.46 
 
 
207 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  43.48 
 
 
254 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
273 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
273 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
273 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
273 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
273 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  40.43 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  65.12 
 
 
492 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  65.12 
 
 
399 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  65.12 
 
 
338 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1118  hypothetical protein  48 
 
 
124 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0357  putative transposase  63.22 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  34.73 
 
 
280 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  31.61 
 
 
276 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  34.73 
 
 
279 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  35.29 
 
 
282 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  35.29 
 
 
282 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
276 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1075  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1250  IS407A, transposase OrfB  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  34.44 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>