More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04488 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04488  transposase  100 
 
 
141 aa  294  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  99.27 
 
 
281 aa  288  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  99.27 
 
 
281 aa  288  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  99.27 
 
 
181 aa  287  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  99.27 
 
 
181 aa  286  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  98.54 
 
 
215 aa  283  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  97.83 
 
 
181 aa  283  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  98.54 
 
 
181 aa  283  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  97.81 
 
 
281 aa  283  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  97.08 
 
 
281 aa  283  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  97.08 
 
 
281 aa  282  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02530  ISXoo3 transposase ORF B  96.45 
 
 
161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  97.08 
 
 
281 aa  282  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  95.65 
 
 
281 aa  280  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  95.62 
 
 
281 aa  275  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  95.62 
 
 
281 aa  275  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  95.62 
 
 
281 aa  275  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  95.62 
 
 
281 aa  275  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  94.16 
 
 
281 aa  273  7e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  96.67 
 
 
114 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4648  integrase catalytic region  60 
 
 
211 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  58.52 
 
 
279 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
240 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  60 
 
 
277 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0152  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
240 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.881638  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0436  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.54183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0497  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0647  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0724  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0845  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0869  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00570165  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0918  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.399507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0992  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1005  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1227  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1308  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1512  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0198167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1760  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1789  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1947  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2073  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0783  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1719  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0006  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0125  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0464  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0491  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0684  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0964  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.466029  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1524  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1629  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00878015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  60 
 
 
277 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>