79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3403 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3403  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  788    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0307453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0450  FAD dependent oxidoreductase  58.49 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00414514  hitchhiker  0.00267481 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4045  hypothetical protein  37.26 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0317207  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4312  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1472  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  20.56 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  41.18 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  18.73 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.78 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  23.44 
 
 		 409 aa  46.2  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1756  D-amino-acid dehydrogenase  44 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.141509 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.78 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.78 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.78 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  24.91 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.78 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.78 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.18 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  42 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  19.03 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.25 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.25 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.25 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  25.51 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  44.19 
 
 		 566 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.49 
 
 		 612 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.22 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.47 
 
 		 503 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 522 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  40 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  22.28 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2597  D-amino-acid dehydrogenase  38 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.25 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  22.28 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  41.18 
 
 		 439 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.25 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  20.51 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  40 
 
 		 422 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.25 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  25.55 
 
 		 488 aa  43.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2467  D-amino acid dehydrogenase small subunit  40 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>