34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0450 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0450  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  788    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00414514  hitchhiker  0.00267481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3403  FAD dependent oxidoreductase  58.49 
 
 		 376 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0307453  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4045  hypothetical protein  35.07 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0317207  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4312  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1472  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0243  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 460 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1955  hypothetical protein  29.7 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 		 491 aa  50.1  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  20.49 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  36.76 
 
 		 508 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  21.07 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  40 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.63 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.94 
 
 		 503 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  24.61 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  38.98 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  22.5 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  34.43 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 369 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  20.21 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  40 
 
 		 511 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 478 aa  43.1  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 403 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 965 aa  42.7  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 362 aa  42.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>