32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4312 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4312  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  749    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3403  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0307453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0450  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00414514  hitchhiker  0.00267481 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4045  hypothetical protein  40.9 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0317207  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1472  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 		 555 aa  50.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 431 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  24.14 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.21 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  48.08 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  19.8 
 
 		 473 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  24.63 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  24.63 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0243  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 522 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  44.9 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.48 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1955  hypothetical protein  23.17 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 806 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 799 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  63.33 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  30.77 
 
 		 666 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>