78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3401 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 
93 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  82.8 
 
 
93 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  78.26 
 
 
92 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  78.95 
 
 
95 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  75.26 
 
 
97 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  75.26 
 
 
97 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  80.95 
 
 
97 aa  146  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  72.63 
 
 
95 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.29 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.03 
 
 
123 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.54 
 
 
104 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.46 
 
 
106 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.33 
 
 
116 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.14 
 
 
120 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.72 
 
 
105 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.69 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.69 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.76 
 
 
107 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  42.11 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  42.67 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16901  hypothetical protein  50.79 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  41.33 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.8 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.33 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.84 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.06 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7525  predicted protein  35.14 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.57 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4191  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.11 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.18 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  37.33 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.14 
 
 
95 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.14 
 
 
95 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4057  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.79 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0910653  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  31.17 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  32.93 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1367  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.62 
 
 
103 aa  48.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00775244  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2245  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.028928  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.18 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5003  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.58 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.335893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.05 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.91 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  30 
 
 
98 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  30 
 
 
98 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3203  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.09 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  44.83 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.83 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.83 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.83 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2100  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.86 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.438966  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2086  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  45.76 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1430  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.435578  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.83 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1450  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.71 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1756  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.83 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000000203468  normal  0.0881793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1533  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  45.76 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.344348  normal  0.976372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3885  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.83 
 
 
116 aa  43.9  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.460728  normal  0.0643134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2441  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.59 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2482  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.24 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1113  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.47 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2213  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.03 
 
 
106 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1833  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 
102 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.43 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000149249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2255  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.86 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2375  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000217025  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0386  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.88 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.86 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00150413  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0742  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2770  ATP-dependent Clp protease adaptor  39.29 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.833115  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0459  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.37 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3193  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.9 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3614  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.92 
 
 
120 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166775  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1824  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.92 
 
 
120 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.507725  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.92 
 
 
120 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.102583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>