53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2843 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  100 
 
 
108 aa  228  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  84.26 
 
 
108 aa  197  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  76.85 
 
 
108 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  76.29 
 
 
97 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  76.29 
 
 
97 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  75 
 
 
116 aa  152  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  81.71 
 
 
136 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  74.44 
 
 
112 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  55.32 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  60.22 
 
 
98 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  50.48 
 
 
145 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  57.32 
 
 
98 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  57.32 
 
 
98 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  58.14 
 
 
98 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.63 
 
 
95 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  52.13 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  52.13 
 
 
95 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4191  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.46 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.24 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.89 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.11 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.51 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.51 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.16 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.68 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.63 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.53 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.53 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.29 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.61 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.1 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.25 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.8 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.16 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.88 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  25.77 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1450  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.14 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  36 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43551  predicted protein  29.9 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0386  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.56 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2375  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.94 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000217025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.47 
 
 
113 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270221  normal  0.0778742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.33 
 
 
96 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.11 
 
 
107 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.78 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2213  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2394  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.93 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.864742  normal  0.0826838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.79 
 
 
106 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1367  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.88 
 
 
103 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00775244  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.85 
 
 
102 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>