86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17021 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 105 aa  209  9e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  97.14 
 
 		 105 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  86.27 
 
 		 105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  70.19 
 
 		 116 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  72.34 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.15 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.82 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.48 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.48 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16901  hypothetical protein  98.41 
 
 		 63 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.67 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.66 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.46 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.46 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  46.88 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.69 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.14 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.69 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5003  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.35 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.335893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.05 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.87 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  35.71 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  35.71 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.58 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1367  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.24 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00775244  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  28.89 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7525  predicted protein  32.1 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  35.14 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1430  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.05 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.435578  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  30.85 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  29.47 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  30.85 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  26.8 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  36.62 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2482  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.97 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2265  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.5 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193826  normal  0.638389 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  29.87 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1533  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.21 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.344348  normal  0.976372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2086  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.04 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3135  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.65 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174383  normal  0.142786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2100  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.62 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.438966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  29.33 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.86 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.86 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3193  ATP-dependent Clp protease adaptor  41.07 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0790  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0838  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.25 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0842  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.25 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1571  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0174248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.9 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0836  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.52 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1116  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.04 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2020  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.9 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  35.9 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.9 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.08 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1768  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.1 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.986908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  28 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0861  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.33 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0386  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.53 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2770  ATP-dependent Clp protease adaptor  35.53 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.833115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.98 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000149249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0788  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.06 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.104793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1236  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.1 
 
 		 102 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.703886  normal  0.878448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.71 
 
 		 133 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2395  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 		 132 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1885  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.07 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  hitchhiker  0.000000637216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.44 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2538  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.56 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1285  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.56 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.154759  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.86 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00150413  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1127  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.62 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0417785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1756  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.98 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000000203468  normal  0.0881793 
 
 
-
 
NC_004310  BR1170  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.62 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128356  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.67 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2110  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.89 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1450  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.66 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  26.83 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.08 
 
 		 98 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.04 
 
 		 109 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2545  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.68 
 
 		 118 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>