70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4494 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  100 
 
 		 108 aa  226  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  77.78 
 
 		 108 aa  183  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  76.85 
 
 		 108 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  84.54 
 
 		 97 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  84.54 
 
 		 97 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  75.49 
 
 		 116 aa  161  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  81.71 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  75.28 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.38 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  56.57 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  59.14 
 
 		 98 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  58.89 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  58.89 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  55.79 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  61.18 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  62.03 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  62.03 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4191  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  55.41 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.78 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.51 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.56 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.56 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.33 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.37 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.14 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.78 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.58 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.58 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.68 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.68 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.68 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.1 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.86 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.13 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.4 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.33 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7525  predicted protein  32.89 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270221  normal  0.0778742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.35 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.84 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0386  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.88 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1450  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.18 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  34.18 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  34.67 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2213  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.84 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  32.53 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.76 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.93 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3885  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.66 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.460728  normal  0.0643134 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.93 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1788  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.82 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.23 
 
 		 103 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.11 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.15 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1236  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.25 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.703886  normal  0.878448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 		 269 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43551  predicted protein  33.33 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.83 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.75 
 
 		 106 aa  40  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2368  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 		 106 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1012  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.29 
 
 		 106 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0946  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.29 
 
 		 106 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0416889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1062  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.29 
 
 		 106 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.88139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1043  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.29 
 
 		 106 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0979  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.29 
 
 		 106 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>