65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3857 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 
112 aa  234  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  72.55 
 
 
116 aa  151  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  75.28 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  73.91 
 
 
97 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  73.91 
 
 
97 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  74.44 
 
 
108 aa  143  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  71.28 
 
 
108 aa  135  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  73.17 
 
 
136 aa  133  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  59.34 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  58.24 
 
 
145 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  59.34 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.12 
 
 
98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  57.95 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  59.52 
 
 
98 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  54.95 
 
 
95 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.98 
 
 
95 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  59.49 
 
 
95 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4191  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.05 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.96 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.8 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.47 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.16 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.16 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.57 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.24 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.35 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.53 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.71 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.07 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.07 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.93 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.29 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.96 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43551  predicted protein  35.53 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.1 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1756  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.1 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000000203468  normal  0.0881793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270221  normal  0.0778742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.78 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2586  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.87 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30210  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.87 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  25.56 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  31.46 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0630  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.14 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.43 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7525  predicted protein  31.43 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1236  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.94 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.703886  normal  0.878448 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  23.47 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2437  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000147491  unclonable  0.0000000000178377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2567  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000498419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1908  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196405  hitchhiker  0.0000000109134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0776  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000544263  hitchhiker  0.00000000015124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5851  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000122416  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2519  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000129347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2426  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3166  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000072504  hitchhiker  0.00105588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.21 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0800  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.73 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355198  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.67 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1450  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.88 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  33.82 
 
 
106 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.82 
 
 
106 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.239107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>