62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1729 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 
97 aa  206  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 
97 aa  206  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  84.54 
 
 
108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  76.29 
 
 
108 aa  163  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  78.35 
 
 
116 aa  160  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  75.26 
 
 
108 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  76.83 
 
 
136 aa  147  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  73.91 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.52 
 
 
98 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  54.55 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  64.94 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  55.91 
 
 
98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  64.94 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  57.95 
 
 
95 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.67 
 
 
95 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  59.74 
 
 
95 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  57.69 
 
 
98 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4191  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.63 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.11 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.04 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.04 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.51 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.27 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.8 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.41 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.25 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.29 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.61 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.26 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.87 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.03 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.03 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 
91 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.86 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.43 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.44 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270221  normal  0.0778742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.7 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  34.21 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2247  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.33 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000664025  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  31.82 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1788  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.68 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7525  predicted protein  31.43 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.87 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  32.65 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3885  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.1 
 
 
116 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.460728  normal  0.0643134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2213  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.34 
 
 
106 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1236  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.33 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.703886  normal  0.878448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1627  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.06 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.339725  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.66 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.43 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2426  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109934  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43551  predicted protein  34.85 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.77 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  32.5 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  33.77 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.66 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1263  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.43 
 
 
108 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.692203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>