40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0940 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  100 
 
 
95 aa  199  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  87.37 
 
 
95 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  86.32 
 
 
95 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  73.12 
 
 
98 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  73.12 
 
 
98 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  74.19 
 
 
145 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  63.64 
 
 
98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  61.36 
 
 
98 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  62.07 
 
 
98 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.25 
 
 
116 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  62.96 
 
 
136 aa  110  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  55.79 
 
 
108 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.95 
 
 
112 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.74 
 
 
97 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.74 
 
 
97 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  56.63 
 
 
108 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.63 
 
 
108 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4191  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.82 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.71 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.71 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.73 
 
 
123 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.94 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.73 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.29 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.86 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.52 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.49 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.47 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.14 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.53 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.82 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.18 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.14 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.86 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  33.78 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.83 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.25 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.82 
 
 
106 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>