53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43896 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 		 97 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 		 97 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.67 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.73 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.35 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.35 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.33 
 
 		 93 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1367  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.15 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00775244  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.21 
 
 		 101 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.11 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.67 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.11 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.25 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.04 
 
 		 107 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.62 
 
 		 105 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.21 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.25 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4191  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.79 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  36.36 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.88 
 
 		 92 aa  45.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.21 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  33.78 
 
 		 95 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28 
 
 		 116 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  33.78 
 
 		 95 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.21 
 
 		 97 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.21 
 
 		 97 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1756  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.65 
 
 		 105 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000000203468  normal  0.0881793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  36 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.46 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.67 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1143  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.68 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1214  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.25 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.609034  normal  0.437761 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7525  predicted protein  30.23 
 
 		 87 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  33.78 
 
 		 95 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5003  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.335893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4801  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0991896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1315  ATP-dependent Clp protease adaptor  38.89 
 
 		 101 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5268  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 131 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.55 
 
 		 113 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5344  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.431551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1113  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.63 
 
 		 97 aa  42  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0386  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.73 
 
 		 100 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0788  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.104793 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0710  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.91 
 
 		 99 aa  40.8  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>