52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3508 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 91 aa  189  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  61.54 
 
 		 91 aa  120  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  72.06 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  57.75 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  47.87 
 
 		 102 aa  95.9  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50.62 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  55.07 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.57 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.14 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.82 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  39.13 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.68 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.88 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.49 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.33 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  36.07 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.56 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.88 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.34 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.18 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  31.34 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2375  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.14 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000217025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.1 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0046  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.35 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.34 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0047  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.68 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00892  hypothetical protein  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.524478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000515979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000549481  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00886  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1250  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1125  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.786271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  32.14 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0615  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.635707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0173302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2279  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00245616  normal  0.0342658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2715  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0985  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174222  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0954  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00274651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.21 
 
 		 100 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.87 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1012  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0979  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1043  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.38 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1062  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.88139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0946  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0416889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.34 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1398  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.88 
 
 		 106 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.071981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>