39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6581 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 102 aa  213  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  47.87 
 
 		 91 aa  95.9  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.75 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.09 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  49.43 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  54.55 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.7 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.58 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.95 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  32.47 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.43 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  30.26 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.84 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.95 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.43 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.14 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.08 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.27 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1250  hypothetical protein  37.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.67 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1125  hypothetical protein  37.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.786271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  25.68 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1760  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.25 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.614449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.58 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2245  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.1 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.028928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0615  hypothetical protein  37.29 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.635707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  28.38 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.14 
 
 		 99 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.99 
 
 		 113 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1533  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.55 
 
 		 104 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.344348  normal  0.976372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.9 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.92 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0710  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.75 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.38 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4057  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.48 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0910653  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.09 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.27 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  30.99 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>