27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2904 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 91 aa  186  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.78 
 
 		 92 aa  135  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  59.04 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.76 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50.62 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  50.6 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.09 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.13 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  36.54 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.17 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  32.84 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.95 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  30.67 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1760  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.614449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.41 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.36 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0459  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  32.84 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0047  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.85 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.67 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  34.38 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2375  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.95 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000217025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.03 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2894  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0292267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0046  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.25 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1250  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>