48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10700 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  181  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.47 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  66.23 
 
 		 99 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  61.04 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.44 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.84 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.14 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.1 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.44 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.67 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.69 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.69 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.23 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.69 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  55.84 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  55.26 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  55 
 
 		 99 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.53 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.01 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50.6 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  55.84 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.57 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  54.55 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  53.09 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.49 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.43 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  58.9 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.25 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.55 
 
 		 101 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  51.32 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50.65 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50.67 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.42 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.03 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.31 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.29 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  30.49 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.82 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.06 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.54 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.38 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2394  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.06 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.864742  normal  0.0826838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.56 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.22 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.99 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>