23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1599 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 92 aa  189  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.78 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  63.33 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  53.26 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  55.07 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.95 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.7 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.03 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  32.97 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  37.25 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0047  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.48 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.76 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0046  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.22 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.54 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  32.39 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0045  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.54 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.34 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  39.22 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0026  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.94 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 103 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.29 
 
 		 96 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>