86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2372 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 96 aa  201  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  77.32 
 
 		 97 aa  157  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  72.63 
 
 		 95 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  75.82 
 
 		 95 aa  143  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.02 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.05 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.04 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.7 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.77 
 
 		 100 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  65.93 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.77 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.77 
 
 		 99 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.95 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  71.05 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  70.13 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.92 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.18 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  66.23 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.63 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.63 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.63 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.83 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.92 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.58 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  59.04 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.47 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.64 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.95 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  58.44 
 
 		 86 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.67 
 
 		 99 aa  96.7  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  46.6 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  55.41 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.89 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.9 
 
 		 101 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.79 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.524478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00886  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2279  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00245616  normal  0.0342658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2715  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0954  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00274651  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0985  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1398  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.85 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.071981 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000515979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0979  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1012  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0946  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0416889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1062  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.88139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1043  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2607  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.99 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1600  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.99 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2693  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.99 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.91 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.75 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2268  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.56 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1711  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.88 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.461096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2368  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.85 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1977  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.88 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.95 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.7 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1111  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.39 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1251  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.38 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.65 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  32.14 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.14 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.14 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.38 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.17 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000957927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.34 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0785  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.76 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0698  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.76 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.89 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.33 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1756  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.62 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000000203468  normal  0.0881793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30210  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.99 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.89 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2586  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.99 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.29 
 
 		 92 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  29.85 
 
 		 91 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>