70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1490 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 100 aa  209  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.76 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.7 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.22 
 
 		 119 aa  120  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  59.38 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.42 
 
 		 99 aa  120  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.73 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.14 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.82 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.18 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.85 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.55 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.38 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.4 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.26 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.04 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  62.5 
 
 		 97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.61 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  60.26 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.58 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.98 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  55.56 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.93 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.88 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  64 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.68 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.41 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  59.49 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.96 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.86 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.56 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.31 
 
 		 93 aa  50.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.91 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.35 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1760  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.95 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.614449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2394  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.11 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.864742  normal  0.0826838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.43 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.08 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.99 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2279  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00245616  normal  0.0342658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000549481  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000515979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  27.08 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.08 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0985  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174222  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0954  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00274651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00892  hypothetical protein  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.524478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00886  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2715  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.59 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0173302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1263  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.65 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.692203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.34 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30210  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.58 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.17 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000149249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2586  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.58 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.89 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.79 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000957927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1398  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.57 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.47 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.58 
 
 		 127 aa  40  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1824  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.58 
 
 		 120 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.507725  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3413  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.58 
 
 		 120 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.58 
 
 		 120 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3614  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.58 
 
 		 120 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>