177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1205 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  63.11 
 
 
643 aa  859    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  72.81 
 
 
640 aa  1033    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  73.28 
 
 
640 aa  1036    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 
642 aa  1316    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  84.19 
 
 
644 aa  1161    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  40.56 
 
 
630 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  40.91 
 
 
631 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  41.54 
 
 
632 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  41.51 
 
 
631 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  42 
 
 
631 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  40.43 
 
 
631 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  40.12 
 
 
631 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  39.81 
 
 
631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  39.81 
 
 
631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  39.81 
 
 
631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  39.81 
 
 
631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  39.81 
 
 
631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  39.97 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  39.22 
 
 
633 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  39.66 
 
 
631 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  39.51 
 
 
631 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  39.51 
 
 
631 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  39.66 
 
 
631 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  38.71 
 
 
631 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  38.95 
 
 
626 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  35.04 
 
 
694 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3553  putative serine protein kinase, PrkA  36.83 
 
 
640 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  34.96 
 
 
690 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2025  protein kinase  37.27 
 
 
640 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  35.1 
 
 
690 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2050  putative serine protein kinase, PrkA  36.36 
 
 
640 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2005  putative Serine protein kinase, PrkA  36.55 
 
 
640 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329127  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1691  PrkA serine kinase  37.27 
 
 
640 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0347  serine protein kinase  37.27 
 
 
640 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1861  serine protein kinase  37.27 
 
 
640 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1873  serine protein kinase  37.27 
 
 
640 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0814  protein kinase  37.27 
 
 
640 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  35.49 
 
 
690 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1742  putative serine protein kinase, PrkA  36.36 
 
 
640 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375663  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  34.96 
 
 
690 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1625  putative serine protein kinase, PrkA  36.96 
 
 
640 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0032  putative serine protein kinase, PrkA  36.29 
 
 
648 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.177761  normal  0.217338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1232  putative Serine protein kinase, PrkA  35.81 
 
 
639 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2469  protein kinase  37.27 
 
 
640 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3904  putative serine protein kinase  35.16 
 
 
640 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1221  putative serine protein kinase, PrkA  36.35 
 
 
648 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.229605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2257  putative serine protein kinase, PrkA  36.08 
 
 
640 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112487  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6236  putative serine protein kinase, PrkA  36.36 
 
 
648 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283326  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2387  putative serine protein kinase, PrkA  36.66 
 
 
640 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203213  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3779  hypothetical protein  36.18 
 
 
640 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2020  putative serine protein kinase, PrkA  36.2 
 
 
650 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2059  serine protein kinase domain-containing protein  36.04 
 
 
650 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292149  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2561  putative serine protein kinase, PrkA  36.5 
 
 
647 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105653  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0733  putative serine protein kinase, PrkA  36.12 
 
 
640 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2157  putative serine protein kinase, PrkA  35.81 
 
 
640 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7069  putative serine protein kinase, PrkA  36.04 
 
 
650 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  36.1 
 
 
640 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1693  putative serine protein kinase, PrkA  36.19 
 
 
648 aa  369  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3963  putative serine protein kinase, PrkA  36.52 
 
 
650 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2820  putative serine protein kinase, PrkA  36.66 
 
 
647 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2334  putative serine protein kinase, PrkA  36.04 
 
 
650 aa  369  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.562553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  34.55 
 
 
644 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  34.07 
 
 
692 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0397  putative serine protein kinase, PrkA  36.15 
 
 
640 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0431  putative serine protein kinase, PrkA  36.15 
 
 
640 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219182  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  34.11 
 
 
692 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1229  putative serine protein kinase, PrkA  36.53 
 
 
640 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.237097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0881  putative serine protein kinase, PrkA  36.57 
 
 
640 aa  363  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4631  PrkA serine kinase  35.68 
 
 
640 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1589  putative serine protein kinase, PrkA  36.69 
 
 
640 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1133  putative serine protein kinase, PrkA  36.69 
 
 
640 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1613  putative serine protein kinase, PrkA  36.69 
 
 
640 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0176  putative serine protein kinase, PrkA  35.5 
 
 
648 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0428  putative serine protein kinase, PrkA  35.99 
 
 
640 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0371656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0547  hypothetical protein  35.74 
 
 
640 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1027  putative serine protein kinase, PrkA  36.72 
 
 
649 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00228838  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1528  putative serine protein kinase, PrkA  36.69 
 
 
640 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629451  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46870  serine protein kinase; PrkA  35.4 
 
 
640 aa  361  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1510  putative serine protein kinase, PrkA  36.69 
 
 
640 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  33.97 
 
 
692 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4751  putative serine protein kinase, PrkA  36.69 
 
 
640 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.734625  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2567  putative serine protein kinase, PrkA  35.57 
 
 
640 aa  360  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0199  putative serine protein kinase, PrkA  36.22 
 
 
640 aa  360  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3056  putative serine protein kinase, PrkA  36.3 
 
 
640 aa  360  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.651845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4017  putative serine protein kinase, PrkA  34.95 
 
 
640 aa  359  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4805  putative serine protein kinase, PrkA  35.68 
 
 
640 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2217  putative serine protein kinase, PrkA  35.5 
 
 
640 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5139  putative Serine protein kinase, PrkA  35.52 
 
 
640 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  33.58 
 
 
681 aa  356  6.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0976  putative serine protein kinase, PrkA  35.73 
 
 
649 aa  355  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07680  hypothetical protein  35.68 
 
 
640 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.115546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02751  putative serine protein kinase, PrkA  35.17 
 
 
640 aa  353  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2327  putative serine protein kinase, PrkA  34.25 
 
 
640 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0509152  normal  0.762867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0731  hypothetical protein  35.52 
 
 
640 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1710  putative serine protein kinase, PrkA  34.72 
 
 
640 aa  352  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  33.78 
 
 
681 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2856  hypothetical protein  35.53 
 
 
643 aa  350  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2725  hypothetical protein  35.53 
 
 
643 aa  350  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0255  putative serine protein kinase, PrkA  35.25 
 
 
649 aa  350  7e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6314  hypothetical protein  37.26 
 
 
580 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>